Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M5

Tpk1, Thiamin pyrophosphokinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpk1Q9R0M5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tpk1Q9R0M5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpk1Q9R0M5 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms