Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Plod1Q9R0E2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Plod1Q9R0E2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms