Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr54Q9R0D8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr54Q9R0D8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms