Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B7

Znf346, Zinc finger protein 346, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf346Q9R0B7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znf346Q9R0B7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms