Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lamc3Q9R0B6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Lamc3Q9R0B6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lamc3Q9R0B6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms