Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpc6Q9R087 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Gpc6Q9R087 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gpc6Q9R087 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpc6Q9R087 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gpc6Q9R087 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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