Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CtsjQ9R014 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CtsjQ9R014 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms