Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZW0

Atp11c, Phospholipid-transporting ATPase 11C, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11cQ9QZW0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atp11cQ9QZW0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atp11cQ9QZW0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms