Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ercc4Q9QZD4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ercc4Q9QZD4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms