Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ88

Vps29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps29Q9QZ88 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps29Q9QZ88 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vps29Q9QZ88 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms