Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VapbQ9QY76 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VapbQ9QY76 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms