Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Nufip1Q9QXX8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nufip1Q9QXX8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms