Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS1

Plec, Plectin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 4,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlecQ9QXS1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
PlecQ9QXS1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
PlecQ9QXS1 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms