Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ChmQ9QXG2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ChmQ9QXG2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms