Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lsm4Q9QXA5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms