Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Psma6Q9QUM9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms