Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Csnk1eQ9JMK2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Csnk1eQ9JMK2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms