Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SrfQ9JM73 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SrfQ9JM73 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms