Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rabgef1Q9JM13 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms