Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trpc4apQ9JLV2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc4apQ9JLV2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms