Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pkd2l2Q9JLG4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pkd2l2Q9JLG4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms