Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arl6ip1Q9JKW0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms