Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Scamp5Q9JKD3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Scamp5Q9JKD3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms