Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Msgn1Q9JK54 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Msgn1Q9JK54 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms