Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Alyref2Q9JJW6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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