Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU8

Sh3bgrl, SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrlQ9JJU8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Sh3bgrlQ9JJU8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sh3bgrlQ9JJU8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sh3bgrlQ9JJU8 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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