Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccl28Q9JIL2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl28Q9JIL2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl28Q9JIL2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl28Q9JIL2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Ccl28Q9JIL2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Ccl28Q9JIL2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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