Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIA1

Lgi1, Leucine-rich glioma-inactivated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi1Q9JIA1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lgi1Q9JIA1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lgi1Q9JIA1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms