Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn12Q9ET43 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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