Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cldn19Q9ET38 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
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Cldn19Q9ET38 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Cldn19Q9ET38 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cldn19Q9ET38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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