Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trim2Q9ESN6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim2Q9ESN6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms