Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN2

Trim39, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM39, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim39Q9ESN2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trim39Q9ESN2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms