Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESM3

Hapln2, Hyaluronan and proteoglycan link protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln2Q9ESM3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hapln2Q9ESM3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hapln2Q9ESM3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms