Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
OtofQ9ESF1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms