Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESC8

Aff4, AF4/FMR2 family member 4, mousemouse

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Length 1,160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aff4Q9ESC8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Aff4Q9ESC8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Aff4Q9ESC8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Aff4Q9ESC8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms