Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Wdr61Q9ERF3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Wdr61Q9ERF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms