Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slco1c1Q9ERB5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Slco1c1Q9ERB5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms