Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Tnfrsf23Q9ER63 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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