Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQU3

Tlr9, Toll-like receptor 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr9Q9EQU3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tlr9Q9EQU3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tlr9Q9EQU3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms