Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPS9

Vmn1r56, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r56Q9EPS9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r56Q9EPS9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r56Q9EPS9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms