Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gpr88Q9EPB7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpr88Q9EPB7 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms