Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rarres2Q9DD06 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rarres2Q9DD06 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms