Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc38a3Q9DCP2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc38a3Q9DCP2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms