Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCH2

Pop7, Ribonuclease P protein subunit p20, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop7Q9DCH2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pop7Q9DCH2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Pop7Q9DCH2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms