Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GabarapQ9DCD6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GabarapQ9DCD6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms