Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cbx6Q9DBY5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms