Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rnf6Q9DBU5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnf6Q9DBU5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms