Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBA6

Tysnd1, Peroxisomal leader peptide-processing protease, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tysnd1Q9DBA6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tysnd1Q9DBA6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tysnd1Q9DBA6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms