Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smg9Q9DB90 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Smg9Q9DB90 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms