Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Znf580Q9DB38 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Znf580Q9DB38 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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